Но так как Худаферинский мост был разрушен по приказу Ибрагимхалил хана, гаджарская армия, с большим трудом переправившись через реку Араз, временно разбила лагерь на берегу реки. В это время защитники Гарабагского ханства пустили вниз по течению реки лодки, нагруженные тяжелыми камнями. Лодки с тяжелыми камнями перекрыли русло реки, вода потекла в сторону шахского лагеря. Неожиданный селевой поток смыл и унес с собой все продовольствие и оружие армии.

Собрав из окрестных селений необходимое количество продовольствия и оружия, Ага Мухаммед шах Гаджар подошел с войсками к Шуше. Шушинская крепость оборонялась под руководством Ибрагимхалил хана. Шах Гаджар, не сумев сломить боевой дух защитников, подверг крепость обстрелу из пушек. При виде разрушенных от пушечного обстрела стен крепости Ибрагимхалил хан, вместе с отрядом выбравшись из крепости, вступил в неравный бой с шахскими войсками. Но он попал в окружение. Несмотря на то что ему удалось выбраться из окружения, вернуться в крепость он не смог. Оборона Шушинской крепости осталась без руководителя. Гаджар призвал шушинцев сдаться. Старейшины Шуши после долгих совещаний отправили своего представителя к шаху Гаджару. Посланец сообщил Гаджару, что население опасается впускать его в крепость.

Источники сообщают, что Ага Мухаммед шах, взяв в руки Коран, поставил на нем свою печать и поклялся, что никому не причинит зла в Шуше. Население же Шуши обязывалось выплатить Гаджару контрибуцию. Требуемая сумма была собрана в течение двух дней, и только после этого врата крепости были открыты.

Убийство Ага Мухаммед шаха Гаджара и отступление армии Гаджара. После Гарабагского ханства Шамахинское, Шекинское и Гянджинское ханства также были подчинены Гаджару.

Несмотря на успехи, эта попытка Гаджара также не увенчалась успехом. Убийство Ага Мухаммед шаха Гаджара летом 1797 года в Шуше в результате покушения оставило его планы незавершенными, сделав невозможным восстановление границ Сефевидского государства. Армия Гаджара покинула северные земли Азербайджана.

Таким образом, создалась благоприятная ситуация для завоевания царской Россией Азербайджана, разделенного на ханства и султанаты.